Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgcrQ01237 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmgcrQ01237 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms