Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2cQ01098 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2cQ01098 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms