Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VegfaQ00731 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VegfaQ00731 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms