Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax8Q00288 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms