Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cds1P98191 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms