Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca2P97929 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brca2P97929 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brca2P97929 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brca2P97929 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms