Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms