Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd1P97443 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd1P97443 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms