Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vgll3P85442 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Vgll3P85442 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms