Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx3P81067 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx3P81067 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx3P81067 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms