Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Erbb2P70424 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erbb2P70424 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms