Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad1P70340 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smad1P70340 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad1P70340 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms