Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vamp7P70280 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp7P70280 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms