Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkn1P70268 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms