Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2bP62915 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms