Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms