Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ElobP62869 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ElobP62869 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ElobP62869 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ElobP62869 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ElobP62869 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ElobP62869 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ElobP62869 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ElobP62869 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ElobP62869 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ElobP62869 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ElobP62869 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ElobP62869 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ElobP62869 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElobP62869 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms