Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps25P62852 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps25P62852 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps25P62852 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps25P62852 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms