Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd1P62315 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd1P62315 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms