Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga11P61622 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga11P61622 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga11P61622 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga11P61622 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga11P61622 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga11P61622 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms