Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf13P61216 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf13P61216 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf13P61216 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms