Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ActbP60710 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ActbP60710 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ActbP60710 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ActbP60710 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ActbP60710 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ActbP60710 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ActbP60710 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ActbP60710 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ActbP60710 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ActbP60710 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ActbP60710 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ActbP60710 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ActbP60710 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms