Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rin3P59729 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rin3P59729 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rin3P59729 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rin3P59729 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rin3P59729 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rin3P59729 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rin3P59729 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms