Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdhd1P59328 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Wdhd1P59328 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wdhd1P59328 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms