Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Senp1P59110 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Senp1P59110 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Senp1P59110 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Senp1P59110 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Senp1P59110 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms