Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Paxbp1P58501 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms