Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf3P58269 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dpf3P58269 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms