Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NcstnP57716 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NcstnP57716 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NcstnP57716 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms