Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c40P56657 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c40P56657 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c40P56657 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c40P56657 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c40P56657 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c40P56657 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms