Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1P56183 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms