Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acod1P54987 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms