Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fdft1P53798 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms