Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpaP53566 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CebpaP53566 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms