Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux1P53564 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux1P53564 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux1P53564 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux1P53564 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux1P53564 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux1P53564 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux1P53564 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cux1P53564 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cux1P53564 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cux1P53564 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms