Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna1P52793 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna1P52793 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna1P52793 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms