Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr5P51682 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms