Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd7P50283 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd7P50283 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms