Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc13P50207 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms