Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd1P48410 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms