Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx1P48377 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx1P48377 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms