Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms