Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-2P42580 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms