Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx1P41778 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pbx1P41778 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms