Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl28P41105 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms