Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cap1P40124 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cap1P40124 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cap1P40124 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cap1P40124 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cap1P40124 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cap1P40124 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms