Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik2P39087 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik2P39087 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms