Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpargP37238 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpargP37238 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpargP37238 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpargP37238 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpargP37238 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpargP37238 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpargP37238 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpargP37238 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpargP37238 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpargP37238 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PpargP37238 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpargP37238 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpargP37238 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpargP37238 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpargP37238 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpargP37238 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms