Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3dP35276 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3dP35276 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms