Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apoc1P34928 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc1P34928 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms