Protein–RNA interactions for Protein: P31996

Cd68, Macrosialin, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd68P31996 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd68P31996 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd68P31996 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd68P31996 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd68P31996 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd68P31996 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd68P31996 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd68P31996 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms